Naruto Shippuden 3D : The New Era est un jeu de combat et de plates-formes sur 3DS. Dans la peau du célèbre ninja blond, le joueur doit traverser divers environnements connus de la série et terrasser de nombreux adversaires pour éviter une guerre certaine. Il peut faire appel à des alliés mais aussi entrer dans un mode Ermite inédit afin de parvenir à ses fins.