Stefan Fischer a étudié l’histoire de l’art, l’histoire et l’archéologie classique à Münster, Amsterdam et Bonn. En 2009, il a soutenu sa thèse de doctorat intitulée «Hieronymus Bosch: Malerei als Vision, Lehrbild und Kunstwerk» (Jérôme Bosch: La peinture comme vision, image instructive et œuvre d’art). Ses axes de recherche sont la peinture néerlandaise du XVe au XVIIe siècle et la muséologie.